1.Դ?源码暑期?????
2.分子对接程序DSDP的安装和使用
3.《魔兽》导演启拍新片 《静音》曝光最新概念照
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7月4日7月7日，为期四天的源码暑期“第二十届中国国际动漫游戏博览会CCG EXPO ”在上海展览中心火热开展。作为国内知名游戏互联网公司，源码暑期同时也是源码暑期CCG EXPO的常客，此次恺英网络携《数码宝贝：源码》《关于我转生变成史莱姆这档事：新世界》《Mecha Party》等项目线下亮相，源码暑期同时旗下IP《百工灵》《岁时令》《KINGNET FAMILY》与数字资产平台“拾元立方”也组队参展开启各类福利活动，源码暑期资金状态指标源码带着全新的源码暑期产品与热情再次与各位动漫届粉丝共享CCG EXPO这场狂欢的动漫庆典。今年5月底开启预约的源码暑期新游《数码宝贝：源码》首次在CCG线下曝光，展区设置了还原游戏场景的源码暑期打卡装置，亚古兽、源码暑期加布兽、源码暑期迪路兽、源码暑期巴鲁兽等耳熟能详的源码暑期数码宝贝悉数登场，格外吸睛，源码暑期引得众多玩家驻足围观拍照，源码暑期现场还设置有游戏体验区，玩家可抢先试玩游戏，作为被选召者提前出发冒险!
《数码宝贝：源码》是由东映动画正版授权，万代南梦宫(上海)娱乐有限公司联合恺英网络共同开发的次世代数码宝贝冒险手游。研发团队采用次世代PBR写实风格数码宝贝和奇幻数码世界搭配的设计理念，期待能带给被选召者们耳目一新的源码包配置沉浸体验。
CCG现场还为玩家们奉上了超多惊喜福利，扫码预约并参与抽奖活动就有机会获得正版手办和游戏原创周边，来恺英网络展台现场打卡，一起传送去那个神秘的“数码世界”吧!
正在火热预约中的正版IP游戏《关于我转生变成史莱姆这档事：新世界》展区也迎来与玩家的面对面互动，展区内超多史莱姆出没，利姆鲁与诸多人气角色的身影吸引各位转生者大人前来聚会，玩家可以挑战完成限时任务赢取周边礼品，预约游戏更有机会获得正版角色手办。
《关于我转生变成史莱姆这档事：新世界》是一款魔国建设策略手游，由超人气动画《关于我转生变成史莱姆这档事》正版IP授权，以利姆鲁的苏醒为故事开端，众多人气角色悉数登场，再现动画人气角色战斗名场面，与你一起从村落开始自由建造利姆鲁的理想王国!游戏预计将于今年夏天正式上线。
于今年初正式登录PlayStation海外服与Steam平台的自研VR游戏《Mecha Party(机甲派对)》亮相CCG现场，这是该游戏首次在国内公开展出，并在展区内设置了VR游戏体验区，抢先体验还未公开发布的全新Meta quest3版本。现场掀起VR热，不少玩家戴上VR穿戴设备，pc qq源码在?沉浸式全景漫游中体验休闲爽快的2v2机甲激战，在虚拟世界中感受身临其境的感觉。
《Mecha Party》是由恺英网络原创自研VR版MOBA类多人竞技游戏，玩家化身机甲爱好者，在VR第一人称座舱中驾驶各种诙谐的机甲，单人或组队进行强社交的MOBA竞技，最多支持3v3在线对战。今年3月海外上线后获得了来自世界各地VR游戏爱好者的广泛好评，而现场体验的Meta quest3版本将于今年暑期正式与玩家见面，届时将有更多的VR爱好者一起加入机甲大战的狂欢派对。
自研IP《百工灵》《岁时令》与数字资产平台《拾元立方》也在本次漫展中悉数亮相，涵盖手办、服饰、原创内容、周边等多个类型，通过小说、漫画、动画、游戏、文创产品等综合载体在年轻人当中普及与传播中华传统文化。滑块协议源码同时吉祥物品牌《KINGNET FAMILY》再度开启线下一番赏活动，各类精美周边抽不停。
爆款产品、趣味互动、奖励丰厚，现场还有更多福利内容等待玩家探索，锁定中央大厅C，更多精彩体验，由你现场揭秘!
分子对接程序DSDP的安装和使用
今年8月，我有幸参加了由北大高毅勤老师团队和华为联合举办的MindSpore SPONGE暑期学校。在这次活动中，我了解了DSDP分子对接程序，该程序的相关论文于今年6月发表在《J. Chem. Inf. Model. , , , –》期刊上。
DSDP程序将传统分子对接算法与机器学习相结合，实现了GPU加速的高性能分子对接。与常用的AutoDock Vina、DiffDock等分子对接程序相比，DSDP在盲对接的速度与精度上均有显著提升。此外，该程序还可在已知结合位点的通道无源码前提下进行重对接和虚拟筛选。项目源码已发布于github。
在暑期学校期间，开发者张宏老师对DSDP程序进行了介绍。以下是我对DSDP程序安装和使用的初步总结，如有疏漏，请大家务必指出。
安装方法：
1. 下载DSDP源码。根据测试，在Ubuntu .（官方文档）和Rocky 9环境中均可使用。
2. 将项目保存在固定目录，我保存在/run/media/Programs/DSDP。
3. 使用Anaconda建立虚拟环境。
注意：务必检查torch的版本，以与cuda环境匹配。如果需要，可直接在DSDP.yml文件中更改torch版本。我这里由于通过配置文件无法正常安装，直接参考官方文档安装了2.0.1+cu版本。
4. 激活虚拟环境（后续每次使用盲对接都需要激活该环境）。
5. 编译各组件。
使用方法：盲对接
项目示例文件的test_dataset包含三个数据集，分别是DSDP_dataset、DUD-E数据集和PDBBind时间分割数据集。
对于要预测的每组复合物，需要建立一个独立的目录，其中存放配体和受体（需按规定命名）。例如，通过tree DSDP_dataset/ | head查看的示例目录结构如下：
DSDP的输入文件为pdbqt格式，可以通过AutoDockTools生成。
注：python 3版本的AutoDockTools，已经有几名Python之狐完成了部分升级，安装好之后直接用prepare_ligand4和prepare_receptor4两个命令就可以调用。
在项目根目录运行如下命令：
参数解释：
重对接
本例使用1a2b蛋白。在工作目录（不一定是项目目录）准备受体和配体的pdbqt文件，命名为protein.pdbqt和ligand.pdbqt。
运行：
注：重对接的盒子信息（沿x y z轴的最小值和最大值）需要用户提供。本例的盒子信息仅适用于本例的1a2b蛋白。
参数解释：
此外，年9月日更新的版本中，每个DSDP组件都支持--help命令来输出有关参数的信息。
DSDP数据训练
DSDP的结合位点预测部分根据PUResNet进行修改。文件train_example包含用于训练当前工作中使用的模型的脚本。应该注意的是，该文件中的训练数据集只是一个示例。整个训练数据集是EquiBind中使用的PDBBind的子集（EquiBind: Geometric Deep Learning for Drug Binding Structure Prediction）。可以从他们的网站下载此数据集：Zenodo。
测试
以PET酶IsPETase为例，下载晶体结构，去水加氢、另存为PET_protein.pdbqt，并与PET_ligand.pdbqt存放于PET目录下。通过上述命令进行盲对接，结果如图1所示。
可以看到，结合位点的搜索十分准确，且将底物定位到了SHD三联体，这与催化机理完全一致。但酯键的方向理应指向蛋白主链形成的氧负离子穴区域，这里所得结构朝向另一侧，可见盲对接的精度略有不足。
进一步在该位点的基础上进行重对接，如图2所示。（盒子中心为催化三联体，边长为 Å）
可以看到，重对接所得的构象中，羰基已经处于正确的朝向，指向Y和M的主链酰胺。以上测试证实了DSDP盲对接和重对接的可行性。
其他
重对接可以在任意目录进行，但盲对接不经修改的话只能在项目根目录进行，其中用到的文件需要自行准备并在命令行指定。个人认为这样稍有不便，因此对源码做了修改，可像重对接一样在任意目录直接进行盲对接，如下。
编译方法和重对接方法同上。盲对接方法如下，其中dataset在当前目录：
注意每次使用盲对接前都需要激活DSDP虚拟环境。
《魔兽》导演启拍新片 《静音》曝光最新概念照
曾在今年暑期推出了全球关注的魔幻大片《魔兽》的好莱坞新锐导演邓肯-琼斯，虽然总是把《魔兽2》的拍摄挂在嘴边，但事实上，他已开始筹备另一部科幻**。这部名叫《静音》（Mute）的科幻惊悚**，目前已经进入到前期筹备阶段，今日发布了最新视觉概念照。该勾勒出了令人压抑的未来城市的氛围，和《魔兽》完全不同，琼斯此次将回归到《源代码》《月球》时期的美学偏好，拍摄一部拥有个人风格的科幻片。
《静音》有望在明年上半年杀青，年初登陆北美院线
《静音》是一部发生在未来的惊悚片，琼斯在接受之前外媒的采访时曾明确表示，这将是他向最爱的经典**《银翼杀手》的致敬之作，而从今日发布的视觉概念图来看，画面确实充满了《银翼杀手》式的迷幻和阴暗调调。影片故事发生在未来的柏林，那是，这座世界名城市已经变成了一个非常动荡的移民城市，影片的男主角是一个酒保，他为了心爱的女友坚强地生活在这里，但女友的神秘失踪改变了他的一切。在寻找女友的过程中，他结识了一个美国外科医生，这个人物的出现引来了更可怕的危机。
影片的明星阵容相当不俗，今年刚刚主演了《泰山归来》的瑞典性感男星亚历山大-斯卡斯加德，扮演男主角。因漫画改编**《蚁人》而在好莱坞大红大紫的保罗-路德，则扮演外科医生，与男主角有很强的对手戏。此外，曾与琼斯成功合作过高口碑科幻**《月球》的柏林影帝得主山姆-洛克威尔，也已确认加盟此片的演出。
《静音》有望在明年上半年杀青，年初登陆北美院线，而根据琼斯的计划，《静音》的绘本小说也将在全球发行。（文 耷子）
