皮皮网

【e源码最专业的源码下载站】【语音助手 源码分析】【vip视频源码ios】氢源码最新版_氢源评测

时间:2024-12-26 03:42:24 来源:文字识别原理源码

1.“分子对接技术”之使用AutoDock进行半柔性对接教程

氢源码最新版_氢源评测

“分子对接技术”之使用AutoDock进行半柔性对接教程

       Autodock是氢源氢源一款主要应用于执行配体—蛋白分子对接的开源软件,由Scripps研究所的码最Olson实验室开发与维护。最新版本为AutoDock 4.2.6,新版包括AutoDock和AutoGrid两个模块。评测e源码最专业的源码下载站软件包及工具的氢源氢源下载地址为autodock.scripps.edu/do...,支持Linux、码最Mac OS和Windows系统以及源代码。新版AutoDockTools是评测AutoDock对接的可视化程序,最新版本为MGLTools1.5.6,氢源氢源下载地址为mgltools.scripps.edu/do...。码最

       对于使用AutoDock进行半柔性对接,新版语音助手 源码分析以蛋白6PL1的评测晶体结构作为受体,晶体结构由PDB网站下载,氢源氢源以其原配体OOJ为分子对接的码最配体,具体操作如下:

       1. 设置工作目录及工作环境:新建一个文件夹作为工作目录,新版确保路径为英文,vip视频源码ios将软件包及下载文件拷贝到此文件夹。

       2. 准备受体:使用pymol、VMD、Schrodinger、DS等软件导入并处理蛋白晶体结构,linux字符驱动源码加氢、计算电荷,保存为6pl1_model1.pdbqt格式。

       3. 准备配体:同样使用上述软件处理配体小分子,确保氢原子、越牛王指标源码电荷及Root的添加,保存为Lig.pdbqt格式。

       4. 进行Autogrid,生成受体网格:导入受体与配体,设置对接的盒子大小、坐标、格点数、隔点距离,生成protein_ligand.gpf网格文件。

       5. 进行分子对接:设置对接受体与对接配体,选择拉马克遗传算法作为对接算法,保存为protein_ligand.dpf文件。

       6. 查看对接结果:加载对接结果,分析分子构象,如聚类、构象叠合等信息。

       以上步骤详细介绍了使用AutoDock进行半柔性对接的整个过程,具体操作可以根据软件界面提示进行。

推荐资讯
adpcm 源码

adpcm 源码

eyy源码

eyy源码

星梦源码_星梦tv源码

星梦源码_星梦tv源码

源码国度

源码国度

starling 源码

starling 源码

相遇源码_相遇软件是干嘛的

相遇源码_相遇软件是干嘛的

copyright © 2016 powered by 皮皮网   sitemap